實驗室凈化工程是除了對實驗樣品的起到保護的作用之外，也是為實驗成功與實驗人員的保駕護航的重大措施之一。實驗室凈化工程是將實驗室某一區(qū)域開辟出來，專門用于建造有空氣潔凈等級的、實驗環(huán)境要求相對較高的實驗室或者無菌室。實驗室凈化工程系統(tǒng)與傳統(tǒng)的潔凈室系統(tǒng)其實是大同小異的，只不過實驗室對潔凈室內的壓力、微生物控制及溫濕度控制相對較工業(yè)潔凈室要嚴格。

常見的實驗室凈化工程裝修材料有夾心彩鋼板、鋼化玻璃、防火板等，潔凈實驗室必須按照《潔凈室施工與驗收標準》采用可以較好的密封并且不產塵的材料進行隔斷、吊頂裝修，潔凈實驗室通風系統(tǒng)一般采用組合式空調機組，其送風系統(tǒng)與各業(yè)潔凈室工程不同的地方是，不是所有實驗室都可以設置回風系統(tǒng)的，這需要根據(jù)用戶實驗室的用途以及實驗產品而定。類似于生物類實驗室就不可以做回風系統(tǒng)，或者說要以全排式潔凈室的做法來施工。

潔凈室按空氣清潔程度分類，如果無塵室的等級只用塵粒數(shù)目來敘述，則可假設塵粒的尺寸為0.5μm，例如，1級、10級、例如100級無塵室塵埃粒子數(shù)目分別小于或等于1顆、10顆、100顆。如果塵粒尺寸不是0.5μm，無塵室等級應以在一特定塵粒尺寸的級數(shù)來表示，分別分為1級、10級、100級、1000級、10000級、100000級，數(shù)值越小，凈化級別就越高。潔凈度越高造價就越高。

萬級無菌室應有內、外兩間，內間是無菌室，外間是緩沖室。房間容積不宜過大，以便于空氣自凈。內間面積2 ×2.5＝5m2，外間面積1 × 2＝2m2，高以2.5m以下為宜，都應有天花板。內間應當設拉門，以減少空氣的波動，門應設在離工作臺遠的位置上，外間的門也用拉門，要設在距內間zui遠的位置上。在分隔內間與外間的墻壁或 "隔扇 "上，應開一個小窗，作接種過程中必要的內外傳遞物品的通道，以減少人員進出內間的次數(shù)，降低污染程度。小窗寬60cm、高40cm、厚30cm，內外都掛對拉的窗扇。