組織推進能源國際合作，按分工同外國能源主管部門和國際能源組織談判并簽訂協(xié)議，協(xié)調(diào)境外能源開發(fā)利用工作。按規(guī)定權(quán)限核準或?qū)徍四茉矗禾?、石油、天然氣、電力等）境外重大投資項目。參與制定與能源相關(guān)的資源、財稅、環(huán)保及應對氣候變化等政策，提出能源價格調(diào)整和進出口總量建議。
綜合司
負責文電、會務、機要、檔案、督查、財務、資產(chǎn)管理等機關(guān)日常運轉(zhuǎn)工作，承擔政務公開、保密、信訪，以及能源行業(yè)統(tǒng)計、預測預警等工作，承擔國家能源委員會辦公室的綜合協(xié)調(diào)工作。
市場監(jiān)管司
組織擬訂電力市場發(fā)展規(guī)劃和區(qū)域電力市場設(shè)置方案，監(jiān)管電力市場運行，監(jiān)管輸電、供電和非競爭性發(fā)電業(yè)務，處理電力市場糾紛，研究提出調(diào)整電價建議，監(jiān)督檢查有關(guān)電價和各項輔助服務收費標準，研究提出電力普遍服務政策的建議并監(jiān)督實施，監(jiān)管油氣管網(wǎng)設(shè)施的公平開放。
法制和體制改革司
研究能源重大問題，組織起草能源發(fā)展和有關(guān)監(jiān)督管理的法律法規(guī)、規(guī)章送審稿，承擔有關(guān)規(guī)范性文件的合法性審核工作，承擔行政執(zhí)法監(jiān)督、行政復議、行政應訴等工作，承擔能源體制改革有關(guān)工作。